Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms