Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNBP48739 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms