Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCC3P46736 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms