Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCAMP43121 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCAMP43121 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms