Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GM2AP17900 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GM2AP17900 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms