Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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