Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C4orf47A7E2U8 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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