Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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