Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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