Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRIT1Q9P2V4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LRIT1Q9P2V4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRIT1Q9P2V4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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