Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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USP35Q9P2H5 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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USP35Q9P2H5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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