Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms