Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFAP61Q8NHU2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms