Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms