Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms