Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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