Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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