Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED6P86452 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms