Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB4BP68371 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 362.9 ms