Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2FP61218 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms