Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA2D1P54289 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms