Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms