Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms