Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIK1P39086 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIK1P39086 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms