Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LTBRP36941 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
LTBRP36941 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LTBRP36941 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LTBRP36941 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LTBRP36941 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LTBRP36941 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms