Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BMI1P35226 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms