Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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GGTLC3B5MD39 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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GGTLC3B5MD39 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GGTLC3B5MD39 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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