Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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