Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms