Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNK4Q9NYG8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms