Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms