Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms