Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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