Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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