Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms