Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms