Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPL39P62891 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPL39P62891 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPL39P62891 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms