Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMTNP53814 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMTNP53814 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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