Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms