Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms