Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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