Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTF1AQ7RTS3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms