Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms