Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms