Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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