Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN10P78369 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN10P78369 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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