Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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USP46P62068 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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USP46P62068 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP46P62068 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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USP46P62068 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP46P62068 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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