Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms