Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms