Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSN1S1P47710 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms